Adanya program Merdeka Belajar – Kampus Merdeka (MBKM) yang diterapkan oleh Kementerian Pendidikan dan Kebudayaan mendorong kolaborasi pelaksanaan pendidikan secara vertikal dan horizontal. Kolaborasi horizontal didorong melalui kerjasama pelaksanaan pembelajaran oleh instansi pendidikan bersama dengan dunia industri, sedangkan kolaborasi vertikal didorong melalui pendampingan perguruan tinggi terhadap penerapan MBKM di SMK.
Salah satu cara untuk memenuhi program Merdeka Belajar – Kampus Merdeka (MBKM), SMK Dr. Soetomo itu menjalin kerja sama dengan Laboratorium Akuntansi FEB UGM. Kegiatan ini dilakukan dengan memberikan pelatihan pemanfaatan SIDEK-Edu kepada guru-guru pengampu mata pelajaran akuntansi di SMK Dr. Soetomo. Pelatihan intensif LMS SIDEK-Edu untuk tenaga pendidik akuntansi dari SMK Dr. Soetomo Surabaya dilakukan dalam dua tahap.
Tahap pertama dilakukan di FEB UGM, pada tanggal 8-9 Agustus 2022 dengan peserta hanya guru-guru akuntansi saja yaitu sebanyak 8 guru. Sedangkan pada tahap 2 dilakukan di SMK Dr Soetomo Surabaya pada tanggal 15-17 September 2022 dengan peserta lebih banyak yaitu guru-guru akuntansi sebanyak 8 orang, dan perwakilan sebanyak 15 siswa jurusan akuntansi
Implementasi LMS SIDEK-Edu di SMK Dr Soetomo Surabaya dilakukan dengan pengembangan khusus, sehingga pendampingan dilakukan secara intensif oleh tim SIDEK-Edu. Pendampingan rutin dilakukan setiap minggunya, sampai sistem dan tenaga pendidik siap secara mandiri.